MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015942	CAT	2	6	255807	255812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198475
5002	NC_015942	CAT	2	6	255933	255938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198475
5003	NC_015942	CCA	2	6	255978	255983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198475
5004	NC_015942	CCG	2	6	256071	256076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198475
5005	NC_015942	CAT	2	6	256092	256097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198475
5006	NC_015942	TAG	2	6	256278	256283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198476
5007	NC_015942	A	6	6	256312	256317	100 %	0 %	0 %	0 %	344198476
5008	NC_015942	GCC	2	6	256318	256323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198476
5009	NC_015942	GGC	2	6	256483	256488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198476
5010	NC_015942	TGG	2	6	256500	256505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198476
5011	NC_015942	GTA	2	6	256525	256530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198476
5012	NC_015942	TGC	2	6	256590	256595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198476
5013	NC_015942	GGA	2	6	256657	256662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198476
5014	NC_015942	CAC	2	6	256692	256697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198476
5015	NC_015942	AC	3	6	256707	256712	50 %	0 %	0 %	50 %	344198476
5016	NC_015942	TGTT	2	8	256718	256725	0 %	75 %	25 %	0 %	344198476
5017	NC_015942	CAT	2	6	256779	256784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198476
5018	NC_015942	TTG	2	6	256838	256843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198476
5019	NC_015942	GTCG	2	8	256957	256964	0 %	25 %	50 %	25 %	344198476
5020	NC_015942	GGGCA	2	10	256987	256996	20 %	0 %	60 %	20 %	344198476
5021	NC_015942	CCTG	2	8	257066	257073	0 %	25 %	25 %	50 %	344198476
5022	NC_015942	TTC	2	6	257099	257104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198476
5023	NC_015942	GAT	2	6	257107	257112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198476
5024	NC_015942	CGG	2	6	257133	257138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198476
5025	NC_015942	TTG	2	6	257147	257152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198476
5026	NC_015942	TTG	2	6	257177	257182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198476
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5028	NC_015942	GAT	2	6	257332	257337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198476
5029	NC_015942	T	6	6	257354	257359	0 %	100 %	0 %	0 %	344198476
5030	NC_015942	AGG	2	6	257554	257559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198477
5031	NC_015942	CAT	2	6	257602	257607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198477
5032	NC_015942	CGG	2	6	257735	257740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198477
5033	NC_015942	TTG	2	6	257759	257764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198477
5034	NC_015942	TCA	2	6	257799	257804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198477
5035	NC_015942	CGT	2	6	257825	257830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198477
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5037	NC_015942	GAT	2	6	257983	257988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198477
5038	NC_015942	ATC	2	6	258077	258082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198477
5039	NC_015942	CTGG	2	8	258088	258095	0 %	25 %	50 %	25 %	344198477
5040	NC_015942	TGGC	2	8	258111	258118	0 %	25 %	50 %	25 %	344198477
5041	NC_015942	CAG	2	6	258128	258133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198477
5042	NC_015942	T	7	7	258306	258312	0 %	100 %	0 %	0 %	344198477
5043	NC_015942	AGTAG	2	10	258319	258328	40 %	20 %	40 %	0 %	344198477
5044	NC_015942	G	6	6	258337	258342	0 %	0 %	100 %	0 %	344198477
5045	NC_015942	GCT	3	9	258415	258423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198477
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5047	NC_015942	GCC	2	6	258448	258453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198477
5048	NC_015942	CG	3	6	258463	258468	0 %	0 %	50 %	50 %	344198477
5049	NC_015942	GCGG	2	8	258481	258488	0 %	0 %	75 %	25 %	344198477
5050	NC_015942	GGC	2	6	258524	258529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198477
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5055	NC_015942	CATGGT	2	12	258707	258718	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344198477
5056	NC_015942	TTC	2	6	258722	258727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198477
5057	NC_015942	CGC	2	6	258787	258792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198477
5058	NC_015942	GC	3	6	258816	258821	0 %	0 %	50 %	50 %	344198477
5059	NC_015942	TGA	2	6	258898	258903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198477
5060	NC_015942	TTC	2	6	258938	258943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198477
5061	NC_015942	GGC	2	6	258944	258949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198477
5062	NC_015942	GGC	2	6	258953	258958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198477
5063	NC_015942	CG	3	6	258984	258989	0 %	0 %	50 %	50 %	344198477
5064	NC_015942	GATA	2	8	259070	259077	50 %	25 %	25 %	0 %	344198478
5065	NC_015942	GCGG	2	8	259095	259102	0 %	0 %	75 %	25 %	344198478
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5070	NC_015942	TGC	2	6	259312	259317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198478
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5072	NC_015942	A	6	6	259380	259385	100 %	0 %	0 %	0 %	344198478
5073	NC_015942	TGA	2	6	259424	259429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198478
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5079	NC_015942	TGGGG	2	10	259565	259574	0 %	20 %	80 %	0 %	344198478
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5088	NC_015942	TCG	2	6	259963	259968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198478
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5094	NC_015942	GC	3	6	260211	260216	0 %	0 %	50 %	50 %	344198478
5095	NC_015942	TCCC	2	8	260465	260472	0 %	25 %	0 %	75 %	344198479
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5105	NC_015942	CG	3	6	260960	260965	0 %	0 %	50 %	50 %	344198479
5106	NC_015942	GGC	2	6	260972	260977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198479
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5108	NC_015942	CAGAG	2	10	261015	261024	40 %	0 %	40 %	20 %	344198479
5109	NC_015942	GTT	2	6	261050	261055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198479
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5112	NC_015942	CAGC	3	12	261178	261189	25 %	0 %	25 %	50 %	344198479
5113	NC_015942	CAG	2	6	261230	261235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198479
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5116	NC_015942	GAT	2	6	261467	261472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198479
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5119	NC_015942	GTG	2	6	261648	261653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198479
5120	NC_015942	ACG	2	6	261700	261705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198479
5121	NC_015942	ATG	2	6	262030	262035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198480
5122	NC_015942	CG	3	6	262106	262111	0 %	0 %	50 %	50 %	344198480
5123	NC_015942	CTT	2	6	262150	262155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198480
5124	NC_015942	GAAA	2	8	262159	262166	75 %	0 %	25 %	0 %	344198480
5125	NC_015942	TCT	2	6	262181	262186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198480
5126	NC_015942	TCT	3	9	262200	262208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198480
5127	NC_015942	CGT	2	6	262257	262262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198480
5128	NC_015942	CAC	2	6	262291	262296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198480
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5130	NC_015942	G	6	6	262530	262535	0 %	0 %	100 %	0 %	344198480
5131	NC_015942	GCC	2	6	262640	262645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198480
5132	NC_015942	CCT	2	6	262647	262652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198480
5133	NC_015942	CCAT	2	8	262709	262716	25 %	25 %	0 %	50 %	344198480
5134	NC_015942	CGT	2	6	262794	262799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198480
5135	NC_015942	GCT	2	6	262822	262827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198480
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5138	NC_015942	GAG	2	6	262924	262929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198480
5139	NC_015942	GAT	2	6	263065	263070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198480
5140	NC_015942	GCC	2	6	263212	263217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198480
5141	NC_015942	CGA	2	6	263283	263288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198480
5142	NC_015942	TCG	2	6	263312	263317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198480
5143	NC_015942	GCC	2	6	263420	263425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198480
5144	NC_015942	GCG	2	6	263452	263457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198480
5145	NC_015942	TCC	2	6	263474	263479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198480
5146	NC_015942	GCG	2	6	263517	263522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198480
5147	NC_015942	GCG	2	6	263532	263537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198480
5148	NC_015942	GGC	2	6	263551	263556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198480
5149	NC_015942	TTC	2	6	263659	263664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198480
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5151	NC_015942	CG	3	6	263873	263878	0 %	0 %	50 %	50 %	344198480
5152	NC_015942	AG	3	6	263902	263907	50 %	0 %	50 %	0 %	344198480
5153	NC_015942	TGC	2	6	263921	263926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198480
5154	NC_015942	GCT	2	6	264417	264422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198481
5155	NC_015942	GCT	2	6	264425	264430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198481
5156	NC_015942	ACC	2	6	264535	264540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198481
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5158	NC_015942	AGT	2	6	264601	264606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198482
5159	NC_015942	GCT	2	6	264625	264630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198482
5160	NC_015942	GCA	2	6	264634	264639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198482
5161	NC_015942	GCCT	2	8	264668	264675	0 %	25 %	25 %	50 %	344198482
5162	NC_015942	TGC	2	6	264748	264753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198482
5163	NC_015942	ATA	2	6	264765	264770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198482
5164	NC_015942	TCTT	2	8	264859	264866	0 %	75 %	0 %	25 %	344198482
5165	NC_015942	TG	3	6	264884	264889	0 %	50 %	50 %	0 %	344198482
5166	NC_015942	GCC	2	6	264893	264898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198482
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5168	NC_015942	CTG	2	6	264926	264931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198482
5169	NC_015942	TGG	2	6	264936	264941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198482
5170	NC_015942	TGCCCT	2	12	264964	264975	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344198482
5171	NC_015942	CGC	2	6	264995	265000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198482
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5173	NC_015942	GTC	2	6	265108	265113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198482
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5177	NC_015942	AGG	2	6	265212	265217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198482
5178	NC_015942	TGC	2	6	265218	265223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198482
5179	NC_015942	TCG	2	6	265237	265242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198482
5180	NC_015942	CGC	2	6	265279	265284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198482
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5184	NC_015942	TGC	2	6	265381	265386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198482
5185	NC_015942	CGC	2	6	265387	265392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198482
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5188	NC_015942	GCGGG	2	10	265531	265540	0 %	0 %	80 %	20 %	344198483
5189	NC_015942	CTGG	2	8	265571	265578	0 %	25 %	50 %	25 %	344198483
5190	NC_015942	GAA	2	6	265629	265634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198483
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5192	NC_015942	GCC	2	6	265709	265714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198483
5193	NC_015942	GCC	2	6	265791	265796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198483
5194	NC_015942	GATCA	2	10	265821	265830	40 %	20 %	20 %	20 %	344198483
5195	NC_015942	CCGT	2	8	265950	265957	0 %	25 %	25 %	50 %	344198483
5196	NC_015942	GGA	2	6	266019	266024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198483
5197	NC_015942	CTT	2	6	266057	266062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198483
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5199	NC_015942	TGC	2	6	266134	266139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198483
5200	NC_015942	GCA	2	6	266246	266251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198483
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5202	NC_015942	GCA	2	6	266318	266323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198483
5203	NC_015942	CAG	2	6	266337	266342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198483
5204	NC_015942	GGC	2	6	266371	266376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198483
5205	NC_015942	CCA	2	6	266396	266401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198483
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5211	NC_015942	TGG	2	6	266615	266620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198483
5212	NC_015942	A	7	7	266640	266646	100 %	0 %	0 %	0 %	344198483
5213	NC_015942	TGC	2	6	266665	266670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198483
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5217	NC_015942	CCA	2	6	266852	266857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198483
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5219	NC_015942	GCG	2	6	266948	266953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198483
5220	NC_015942	ACC	2	6	266968	266973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198483
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5224	NC_015942	CCG	2	6	267128	267133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198483
5225	NC_015942	GC	3	6	267168	267173	0 %	0 %	50 %	50 %	344198483
5226	NC_015942	TGG	2	6	267201	267206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198483
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5228	NC_015942	T	6	6	267240	267245	0 %	100 %	0 %	0 %	344198483
5229	NC_015942	CGA	2	6	267254	267259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198483
5230	NC_015942	AGGC	2	8	267264	267271	25 %	0 %	50 %	25 %	344198483
5231	NC_015942	GCG	2	6	267296	267301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198483
5232	NC_015942	GCA	2	6	267311	267316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198483
5233	NC_015942	GCC	2	6	267323	267328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198483
5234	NC_015942	CGC	2	6	267329	267334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198483
5235	NC_015942	GCT	2	6	267362	267367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198483
5236	NC_015942	GGT	2	6	267407	267412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198483
5237	NC_015942	ATC	2	6	267459	267464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198483
5238	NC_015942	GCA	2	6	267545	267550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198483
5239	NC_015942	AGC	2	6	267646	267651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198483
5240	NC_015942	CGC	2	6	267887	267892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198483
5241	NC_015942	CG	3	6	267992	267997	0 %	0 %	50 %	50 %	344198483
5242	NC_015942	GTGAA	2	10	268027	268036	40 %	20 %	40 %	0 %	344198483
5243	NC_015942	GGC	2	6	268074	268079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198483
5244	NC_015942	G	6	6	268091	268096	0 %	0 %	100 %	0 %	344198483
5245	NC_015942	TGG	2	6	268214	268219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198483
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5247	NC_015942	CCA	2	6	268253	268258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198483
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5253	NC_015942	A	7	7	268599	268605	100 %	0 %	0 %	0 %	344198483
5254	NC_015942	GCGCAG	2	12	268794	268805	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344198483
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5272	NC_015942	AAGAGG	2	12	269566	269577	50 %	0 %	50 %	0 %	344198484
5273	NC_015942	CGG	2	6	269600	269605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198484
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5354	NC_015942	CAGA	2	8	274155	274162	50 %	0 %	25 %	25 %	344198488
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5359	NC_015942	GGCA	2	8	274298	274305	25 %	0 %	50 %	25 %	344198488
5360	NC_015942	TGG	2	6	274312	274317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198488
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5362	NC_015942	CGG	2	6	274375	274380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198488
5363	NC_015942	CCG	2	6	274387	274392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198488
5364	NC_015942	CGC	2	6	274520	274525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198488
5365	NC_015942	CTG	2	6	274539	274544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198488
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5375	NC_015942	CACC	2	8	274897	274904	25 %	0 %	0 %	75 %	344198488
5376	NC_015942	GCC	2	6	274928	274933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198488
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5445	NC_015942	CTG	2	6	278526	278531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198491
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5450	NC_015942	CTGG	2	8	278660	278667	0 %	25 %	50 %	25 %	344198491
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5473	NC_015942	CTG	2	6	279925	279930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198492
5474	NC_015942	TGG	3	9	279935	279943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198492
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5476	NC_015942	GCCG	2	8	280036	280043	0 %	0 %	50 %	50 %	344198492
5477	NC_015942	GCA	2	6	280058	280063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198492
5478	NC_015942	GGC	2	6	280188	280193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198492
5479	NC_015942	GGGT	2	8	280206	280213	0 %	25 %	75 %	0 %	344198492
5480	NC_015942	A	6	6	280298	280303	100 %	0 %	0 %	0 %	344198492
5481	NC_015942	TAT	2	6	280315	280320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198492
5482	NC_015942	GCT	2	6	280344	280349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198492
5483	NC_015942	ATC	2	6	280367	280372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198492
5484	NC_015942	GCAG	2	8	280423	280430	25 %	0 %	50 %	25 %	344198492
5485	NC_015942	TGG	2	6	280442	280447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198492
5486	NC_015942	TGT	2	6	280470	280475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198492
5487	NC_015942	GTT	2	6	280557	280562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198492
5488	NC_015942	CGG	2	6	280598	280603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198492
5489	NC_015942	AATG	2	8	280608	280615	50 %	25 %	25 %	0 %	344198492
5490	NC_015942	CCT	2	6	280652	280657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198492
5491	NC_015942	CG	4	8	280668	280675	0 %	0 %	50 %	50 %	344198492
5492	NC_015942	GCG	2	6	280682	280687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198492
5493	NC_015942	AAT	2	6	280705	280710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198492
5494	NC_015942	TGG	2	6	280757	280762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198492
5495	NC_015942	CTGC	2	8	280818	280825	0 %	25 %	25 %	50 %	344198492
5496	NC_015942	CGA	2	6	280848	280853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198492
5497	NC_015942	GGC	2	6	280965	280970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198492
5498	NC_015942	CCCCAG	2	12	281026	281037	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	344198492
5499	NC_015942	GC	3	6	281050	281055	0 %	0 %	50 %	50 %	344198492
5500	NC_015942	GAC	2	6	281091	281096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198492

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